Переустанови pfsense с нуля и не делай никаких "лишних" настроек.
Смотри логи на предмет ошибок. Подозреваю, что у тебя просто постоянно перегружаются какие-то настройки, может и все фильтры, что и заставляет php так нагружать процессор постоянно.
Либо смотри логи и копайся в чем проблема, но лучше просто поставь все с нуля и внимательно контролируй каждое действие, не делая ничего лишнего. Таким образом проконтролируешь ошибки и момент, в котором начинается такая аномальная активность