Спасибо за ссылку конечно, искал да не нашел ;)
Нашел такое решение проблемы: удалил старый конфиг, перезагрузил, Transmission создал новый. Подкорректировал новый конфиг, перезагрузил, всё заработало штатно. Да еще один нюанс: конфиг править только при остановленом сервисе иначе перезапишет на стандартный.