У вас папка /usr/pbi/lightsquid-i386/local/www/lightsquid вообще существует ? Что говорит cd /usr/pbi/lightsquid-i386/local/www/lightsquid ?
Папка /usr/local/www/lightsquid/tpl/base присутствует или есть ли софт-линк на нее ?
содержимое ```
ls /usr/pbi/lightsquid-i386/local/www/lightsquid
.htaccess common.pl graph.cgi lightparser.pl topsites.cgi user_month.cgi
bigfiles.cgi day_detail.cgi group_detail.cgi month_detail.cgi tpl user_time.cgi
check-setup.pl get.cgi index.cgi report user_detail.cgi whousesite.cgi
/usr/local/www/lightsquid/tpl/
но папки **base в** ней нет