Bom dia, problema resolvido.
O que acontecia, eu tenho além da VPN site to site entre servidores pfsense nas unidades, uma VPN para quando os usuários estão externamente e nessa VPN estavam publicadas todas as redes, na opção de rede remota.
O que acabou ocasionando um conflito nas rotas dentro do Pfsense, estranho que isso já estava assim há muito tempo e funcionando.
De qualquer forma, ao retirar a publicação das redes, na opção de redes remotas na VPN, funcionou imediatamente.
Se puderem, fechem o post, não achei a opção.