Recuerden que un dominio como google.com, yahoo.com, su pagina hace uso de varios otros sitios para poder armar todo el contenido como videos, imagenes, javascripts, etc para poder mostrarnos o pintar la pagina, no solo es www.yahoo.com, asi funcionan hoy en dia infinidad de sitios dinamicos.
Pero si se meten a leer los logs de squid, squidGuard podran ver todos los bloqueos de dominios que no se ve logran ver.
Se tiene uno que ensuciar las manos, por ejemplo skype hace uso de una lista grande de sitios para poder cruzar por un proxy no-transparente, por lo general en una organizacion no es recomendable un proxy transparente, esto es mas de lado WISP, cybercafes, una empresa necesita seguridad, un proxy transparente no la da.
Es mi comentario, saludos.