Olá pessoal, só passando um feedback para quem se interessar pelo mesmo assunto que eu e deseje saber no que se desenrolou.
Com o Ntop, consegui o registro de todo o tráfego dos PCs da rede para internet, ele expõe tudo mesmo. Até por causa disso, liguei o alerta de como é fácil ficar "farejando" o tráfego de rede. Vou buscar na comunidade de segurança como eles lidam com este tipo de assunto.
Enfim, o que eu realmente precisava era o tráfego que é realizado entre os servidores e computadores, ex.: Quem mais envia ou recebe dados para um servidor. E para isso ele não me deu resultados.
De qualquer forma, o ntop é muito interessante, vou mantê-lo. Vi que tem recursos úteis.
Agora peguei PRTG e este sim trouxe a informação desejada. Ainda estou mexendo nele, espero ter sucesso no que preciso.
Novamente agradeço a todos!
Só consegui dar um "thank you" em apenas um comentário. Queria fazer o mesmo para o nosso amigo andrezaomac.