Gracias por la respuesta, mira, los RRD Graphs los revisé hasta que me aburrí y no muestran nada extraño, todo dentro de lo normal, lo sé porque siempre les hecho un vistazo.
Sobre las tarjeta tengo una dlink para la LAN y una Intel 10/100/1000 para la WAN. Como dato, hace 2 meses tenía instalado pfSense 1.2.3. y todo funcionaba bien, no se notaba lentitud, los pings de monitoreo ( Nagios ) no mostraban variaciones, los tests hechos en http://www.pingtest.net/ mostraban todo normal, un ping bajo, jitter bajo tambièn, etc. Migré a pfSense 2 y empezaron los problemas, me hicieron volver a 1.2.3 y sigue todo igual. Lamentablemente, como me queda lejos, buscaron otra solución y les instalaron Endian, y ahora dicen que anda todo perfecto, igual que antes.
Tengo la sensación amarga de que se podría haber solucionado, pero no alcancé. Pensaba que si sería problema del "router" este tendría que haber también provocado problemas en esta otra solución.