Hola.
Es mucho trabajo lo que tienes que hacer, no se en que punto estarás… pero vamos por partes.
Router: El router según veo va por interfaz WAN con RJ45 (LAN), así que entiendo que debes de tener otro router que recoja la entrada RJ11, o directamente te lo han puesto con RJ45. Debes de tener en cuenta que si hay otro router, debes de mirar una configuración en modo bridge si quieres que se gestione desde el CISCO, o directamente el Pfsense, o si es directamente LAN, saber si el ISP está aplicando alguna regla de filtrado o deja pasar todo el trafico.
La conexión Wifi tendrá que suministrarse desde el CISCO, configurando el AP.
En temas de P2P no puedo ayudarte porque no he trabajado con ello.
Después, en el tema de configuración del PFSENSE, los manuales que ha stickeado Bellera te debería ser suficiente para configurarlo. Revisa lo siguiente:
http://www.bellera.cat/josep/pfsense/indice.html
http://forum.pfsense.org/index.php/topic,45034
Aunque en general toda la ayuda la puedes encontrar en http://forum.pfsense.org/index.php/topic,23409.0.html según el problema que te surja.
Saludos.